Hopper estudia en varias escuelas privadas para mujeres, y en 1924 ingresa en el Vassar College en Nueva York, donde estudia matematicas y fisica, graduandose con honores en 1928. Poco despues, obtuvo una beca para cursar una maestra a en matematica en la universidad de Yale, donde se gradua en 1930 y obtuvo su doctorado en 1934.Le ofrecieron un puesto como asistente en el departamento de matematica del Vassar College, donde permanece hasta 1943. Mientras tanto, continua sus estudios en Yale, donde se doctora en matematica en 1934